Церковь Алексия, митрополита Московского, в нижнем этаже Воскресенского храма в Акатовом Алексеевском монастыре в г. Воронеже построена и освящена 20 мая 1812 г.
Первая церковь устроена основателем Акатова монастыря игуменом Кириллом и посвящена св. Московскому митрополиту Алексию, вследствие чего и самый монастырь стал называться Алексеевским.
О побуждениях посвятить храм св. Алексию составитель описания Акатова монастыря архимандрит Илларион (Воронежские Епархиальные Ведомости 1883 г. № 19) говорит: «иноки этой обители поселились на пути татар к Москве, а так как память св. Московского Алексия была в то время еще свежа и уважение к нему, как ревностному патриоту и чудотворцу русскому от жителей Москвы и соседних провинций России было, то и избрали своим молитвенником и покровителем того святителя, который чудесным исцелением ханской жены Тайдулы смягчил жестокость татар и своим заступничеством не раз спасал Россию от ига иноплеменных». Может быть, и игумен Кирилл был постриженик Чудовской обители в Москве, построенной св. Алексием.
Думают, что и первая церковь в честь св. Алексия в Акатовом монастыре была каменная, но это едва ли верно, так как постройка каменных церквей в XVII-XVIII ст. обходилась дорого, да и мастеров-строителей каменных церквей в России, особенно в провинциальных городах, было мало, и первый каменный храм в Воронеже, как известно, был построен св. Митрофаном – Благовещенский собор без пособия от правительства. Акатов монастырь был скуден и не имел в начале XVII ст. средств для постройки каменной церкви.
Вторая церковь в честь того же святителя была каменная и, вероятно, построена к концу XVII ст., если не позже. О ней упоминается в указе от 1746 г. 19 марта, что она каменная, построена издревле, но так как от нетвердого фундамента во многих местах повредилась, то велено ее разобрать и основать на новом фундаменте и в то же наименование в честь св. Алексия. Во время постройки этой церкви богослужение отправлялось в малой трапезной церкви в честь Владимирской иконы Богоматери.
В начале Алексеевская церковь была однопрестольная и одноэтажная. В 1748 г. Феофилактом, епископом Воронежским, было разрешено на каменной Алексеевской церкви построить верхнюю церковь в честь Владимирской иконы Божией Матери, а трапезная, прежде бывшая Владимирская, в 1746 г. была переименована во имя преп. Антония и Феодосия Киевопечерских.
В 1796 г. архимандрит Амвросий испросил у епархиального начальства разрешение, вследствие оказавшихся ветхостей, разобрать церковь до основания, а на время на братской трапезе поставить деревянную церковь, купленную в Тавровской крепости. В 1798 г. эта церковь была окончена и освящена; верхний храм был по-прежнему посвящен Владимирской иконе Божией Матери, а нижний св. Алексию с приделом преп. Антонию и Феодосию.
Митрополит Евгений в описании Воронежской епархии говорит, что каменная двухэтажная в Акатовом монастыре церковь построена в 1674 г. старанием игумена Иосифа Горяинова от вотчинных доходов и мирского подаяния. В 1835 г. нижняя церковь в честь св. Алексия была возобновлена, причем она была освящена архиепископом Воронежским Антонием в честь св. Митрофана Воронежского, при архимандрите Варлааме, так как в честь св. Алексия устраивался престол в новом храме. Нижняя церковь, прежде бывшая Алексеевская, а затем с 1835 г. Митрофановская, с устройством печей, была теплая и богослужение в ней отправлялась зимою, а летом и в верхней Владимирской.
При сей церкви в связи с нею двухъярусная каменная колокольня, соразмерной величины, готической архитектуры. Колокольня существует и ныне, а самая церковь была разобрана до основания в 1879 г. при настоятеле обители епископе Филарете.
Новая каменная церковь двухэтажная: вверху – в честь Воскресения Христова, а внизу – св. Алексия, Московского митрополита. Нижний Алексеевский храм был освящен 20 мая 1812 г.; в 1844 г. этот храм при преосвящ. Ельпидифоре был возобновлен и вновь освящен в октябре того же года. Настоятели монастыря сперва были игумены – с 1620 по 1700 гг., затем архимандриты – с 1700 по 1842 гг. и, наконец, епископы – с 1842 г.
«Указатель храмовых празднеств в Воронежской епархии» выпуск 2, Воронеж. Типография В.И. Исаева, 1884 г.