В период с 1846 по 1848 годы в волости Кавилда Тартуского уезда в православие перешло свыше 1700 лютеран, т.е. около четверти тогдашнего населения волости. Православный приход Кавилда начал свою деятельность в 1846 году (до 1868 года он был известен под названием Удерна). До возведения церкви приход располагался в нескольких помещениях, переделанных под проведение религиозных обрядов (богослужения проводились в амбарах и на гумне). В 1868 году приход получил на строительство церкви и организацию кладбища около 125 гектаров земли, ранее относящейся к казённой мызе Кавилда. Церковь из бута была построена в 1873 году на средства Министерства внутренних дел по проекту архитектора Рижской православной епархии Г. Шеля. В то время строительство православных храмов в Тартуском уезде переживало свой расцвет. К началу XX века в уезде насчитывалось около 25 православных церквей, причём три четверти из них были построены в 1860-1870-ые годы. Также в уезде действовали многочисленные православные школы: церковно-приходская школа в Кавилда была открыта в 1872 году в доме, расположенном недалеко от церкви (церковно-приходская и вспомогательная школы работали вплоть до 1918 года. В 1850 году количество прихожан в приходе Кавилда составляло 1515 человек, в 1900 – 1161 человек, в 1916 – 791 человек, в 1938 – 473 человека. В дальнейшем число прихожан продолжало снижаться. Свою роль в этом сыграли Вторая Мировая война, репрессии и атеистический характер советского периода.
В 1954 году в приходе Кавилда насчитывалось всего 32 прихожанина, и в этом же году в приходе было проведено 15 обрядов крещения и 5 похорон. В 1961 году было проведено всего 15 богослужений крещено 5 человек и 4 - похоронены. День поминовения усопших в этом году не проводился, поскольку власти не дали на него своего разрешения. Деятельность православного прихода в некоторой степени продолжалась вплоть до 1974 года, а после окончательно угасла. Опустевшее здание церкви, оставшееся без своего священника и какого-либо надзора, несколько раз становилось объектом для взломов. В 1973 году из церкви в Кавилда было украдено 15 икон, которые позже были обнаружены в Таллинне. В 1977 году из церкви опять похитили иконы и прочую церковную утварь; из примерно 90 произведений искусства, хранящихся в церкви Кавилда, уцелела только половина. Окно церкви было разбито, решетки перепилены. Согласно актам, составленным в 1979 году, часть уцелевшего церковного имущества была перенесена в церкви Удерна, Васкнарвы и других. Церковь была закрыта, а двери и окна храма заколочены. Последним настоятелем прихода до 1955 года являлся отец Михаил (Вознесенский), который затем служил в приходе в качестве заместителя до 1975 года, т.е. по необходимости приходил в храм, чтобы провести какой-либо церковный обряд. В 1961 году зарплата попечителя прихода Кавилда составляла 25 рублей в год, а с 1964 года священник и вовсе перестал получать зарплату. По воспоминаниям патриарха Алексия II, приход Кавилда закрыли после кончины протоирея Вознесенского в 1976 году. Некоторое время угасающий приход опекал С. Кружков. В 2003 году местные жители восстановили приход, по их инициативе были организованы масштабные субботники, в ходе которых заросшая разваливавшаяся церковь была приведена в порядок снаружи и внутри. Духовным попечителем прихода в 2011 году был назначен иеромонах Геннадий (Кружков).
