По данным описи 1626 года, церковь Николы Чудотворца находилась в крепости на городской площади, на северо-восток от Троицкого собора. В Козью Слободку, на нынешнее место, её перенесли в 1775-1779 гг. на общественные деньги и построили каменной. Первоначально храм был небольшим - однопрестольным. В 1844 г. к нему была пристроена трапезная часть с двумя приделами: в честь Тихвинской иконы Божией Матери и святителей Московских Петра, Алексия, Ионы, Филиппа и Ермогена, а также колокольня. Ниже храма был Козинский овраг, а возле него - одно из самых старых известных калужских кладбищ, которое просуществовало до 1780 года. Постепенно место кладбища занималось и к 1824 году было застроено частными домами. Своим благоустройством храм во многом обязан калужскому мещанину Ф.А. Извекову, церковному старосте. В 1848 году при храме открылась церковно-приходская школа.
Свято-Никольский храм имеет богатое убранство, сохранились все иконостасы. Главный - высокий, пятиярусный - выполнен в конце ХVIII века. Двухъярусные иконостасы приделов наряду с иконами ХIХ века содержат и более ранние. Особо почитается прихожанами храмовая житийная икона святителя Николая, перенесённая ещё из прежнего деревянного храма. Перед правым клиросом, у солеи, помещена икона Благовещения Пресвятой Богородицы, датированная первой половиной ХVIII века, из разрушенного Благовещенского храма. С 10 октября 1935 года до 17 октября 1936 года храм был закрыт и использовался под склад "Заготзерно". Затем в нём до 1939 года находилась кафедра обновленческого "архиерея" А.И. Расторгуева. В ноябре 1941 года храм был передан Православной церкви. В середине января 1942 года Никольский храм был снова закрыт и возвращён Церкви лишь 1 июня 1945 года. Настоятелем был назначен вернувшийся в 1944 году из ссылки протоирей Георгий Васильевич Соколов.
Николо-Козинский храм являлся местом служения бывшего викария Калужской епархии, архиепископа Людиновского Георгия, который и был погребён в 2010 году в северной части церкви. С 1992 года при храме действует воскресная школа. Наряду со Свято-Георгиевском собором Николо-Козинский храм в самые страшные богоборческие годы в Калуге являлся очагом духовного спасения поборников Веры Христовой.
Из материала набор открыток: Сергей Коробцов. "Храмы земли Калужской". Калуга, 2012 г.