В 1895 году был учреждён независимый приход, в состав которого вошли православные из Синди, ранее относившиеся к приходу Тори. С 1864 года священник прихода Тори ежемесячно проводил богослужения в деревянной церкви Святой Варвары. В 1899 году, на деньги московского купца Р. Шёна и средства, выделенные суконной фабрикой в Синди, было завершено Строительство церквию Внушительное здание, построенное из красного кирпича, , оштукатуренное изнутри, с колокольней и восьмиугольной башней, увенчанной луковичным куполом, было освящено архиепископом Рижским Агафангелом. В отличии от других православных церквей Пярнуского уезда, при декорировании трёхчастной церкви ( с притвором, центральным нефом и апсидой ) были использованы элементы так называемого "русского барокко". Во время советской власти, в 1962 году, приход был ликвидирован, а храм превращён в склад для реквизита Пярнуского театра "Эндла". Церковь начала разрушаться. Храмовая парча была пущена на пошив сценических костюмов.

В 1980 году у здания ещё было четыре башни. в том числе над центральным нефом. Конструкция крыши церкви была частично обновлена в начале 1990-ых годах, а также был снесён купол над центральным нефом и заменён ровной кровлей. Расположенная в апсиде маленькая башня с палаточным куполом осталась нетронутой. Церковь Синди, которая когда-то считалась одним из красивейших зданий в городе, к началу XXI века находится в плачевном состоянии. Внутри церкви центральный неф был разделён на две части временной перегородкой, при этом притвор использовался для проведения богослужений восстановленным двуязычным приходом. В 2007 году продолжилось восстановление храма в рамках государственноой программы по охране памятников старины. По ходотайству ЭАПЦ город Синди безвозмездно передал здание в лоно церкви.