Строительство церкви в с. Борискино Бугульминского уезда началось в 1870-х гг. после того, как епископом Самарским и Ставропольским Герасимом 21 июня 1868 г. была на то выдана так называемая храмозданная грамота. Церковь, построенная в 1882 г. на добровольные пожертвования жителей с. Борискино – каменная, неотапливаемая, имела железную крышу и каменную колокольню, вмещала до 1000 человек и имела два придела.
Церковь построена на небольшой площади в центре села и не имела ограды; кладбище, окопанное канавой, расположилось вне селения. Главный престол церкви освящен 20 мая 1882 г. во имя Святой Троицы. Первый придел во имя Герасима Иорданского построен в 1870-х гг. и освящен 7 июня 1878 г., второй придел освящен 2 июля 1887 г. во имя бессребреников Космы и Дамиана. Во всех приделах церкви имелись святые антиминсы.
В 1905 г. церковь посетил епископ Самарский и Ставропольский Константин, в 1910 г. церковь застрахована во Взаимно-страховом отделе духовного ведомства на сумму 40 тысяч рублей...
В начале 1930-х гг. у церкви разрушены колокольня и покрытие трапезной. В 1940-х гг. проводились работы по приспособлению здания церкви под винное производство, позднее у церкви разобрали кровлю. В списке учета недействующих церквей Чкаловской (Оренбургской) области за 1946-1960 гг. и в списке действующих церквей Чкаловской области, открытых в 1944-1948 гг., церковь в с. Староборискино не значится.
Согласно списку действующих церквей Оренбургской области на 1 декабря 1990 г. Свято-Троицкая церковь с. Староборискино указана как действующая и единственная на территории Северного района имела такой статус. В начале 1990-х гг. церковь находилась в стадии восстановления и реставрации.
Решением Оренбургского облисполкома от 2 июля 1991 г. № 158 Свято-Троицкая церковь в с. Староборискино включена в список памятников истории и культуры Оренбургской области, подлежащих охране как памятника местного значения. В списке действующих церквей Оренбургской области по состоянию на 8 августа 2016 г. указана Свято-Троицкая церковь с. Староборискино.
Источник: Православные исторические храмы Оренбуржья: научно-популярное справочное издание. - Оренбург, 2019. С. 363-364.