Церковь во имя св. Троицы, существовавшая в XVI ст. в селе Свиблове, вероятно, была уничтожена в начале XVII ст. в литовское смутное время. В писцовых книгах 1623-24 гг. написано: «за стольником Андреем Плещеевым в вотчине, что ему дал отец его Лев Плещеев, а отцу его Льву та вотчина дана за московское осадное сиденье королевичев приход, село Свиблово, на реке Яузе, а в нем был храм во имя Живоначальной Троицы, да церковной земле четыре места: попово, дьячково, пономарево, да просвирницыно; пашни церковные земли 20 четвертей в поле, сена на реке Яузе 10 копен; в селе двор вотчинников, живут деловые люди, 2 двора людских задворных; а пашет церковную землю стольник Андрей Плещеев».
В 1658 г. владел селом его родной брат Михаил Львович Плещеев, при котором и была построена в селе Свиблове около 1677 г. новая деревянная церковь во имя Живоначальной Троицы с приделом св. Алексея митрополита и обложена данью. В переписных книгах 1678 г. значится: «за стольником Михаилом Львовичем Плещеевым в вотчине село Свиблово, на реке Яузе, а в селе церковь Живоначальной Троицы, да придел Алексея митрополита, у церкви во дворе поп Яков, во дворе дьячок Ворфоломейко, да в селе двор вотчинников и двор скотный, в них 9 семей деловых людей, 4 двора конюхов и 4 двора поваровых, в них 11 человек». В 1680 г. при церкви священника не было.
После М. Л. Плещеева село Свиблово досталось его родным племянникам Семену и Федору Федоровичам Плещеевым; в 1702 г. оно принадлежало дочери Семена Федоровича Плещеева девице Марье, а от нее перешло к ее родному дяде Кириллу Алексеевичу Нарышкину, за которым оно утверждено в 1704 г. отказною книгою: «отказано кравчему Кириллу Алексеевичу Нарышкину племянницы его девицы Марьи Семеновны Плещеевой вотчина, что ему, Кириллу Алексеевичу, в 1704 году, по именному великого государя указу и по устному ее девицы Марьину завещанию, по допросу отца ее духовного Благовещенского собора, что в Верху на Сенях, ключаря Ивана Афанасьева, дана в Московском уезде, в Манатьине, Быкове и Коровине стану село Свиблово, на реке Яузе, а в нем церковь во имя Живоначальной Троицы, да придел во имя Алексея митрополита древянна, клетцки, да в том же селе Свиблове двор вотчинников со всяким дворовым и хоромным строеньем и с садом, и всяким заводом, а во дворе дворовых и деловых людей 6 человек, 4 двора задворных и 3 двора дворовых людей, в них 14 человек».
В селе Свиблове в 1708 г. построена каменная церковь св. Троицы и ко дню освящения того же года 24 декабря «по благословенной грамоте выдан антиминс в новопостроенную церковь Живоначальной Троицы, а взял антиминс поп Яков Иоаннов». Под 1709 г. значится: «в селе Свиблове церковь Живоначальной Троицы с приделом св. вмч. Георгия каменная, у церкви во дворе поп Филипп Леонтьев, служит годовую службу, двор вотчинников (Кирилла Нарышкина), а по сказке старосты Федота Тимофеева, из боярского двора и из задворных дворов люди все вывезены в разные вотчины и в тех дворах живут шведы всякие мастеровые люди».
В 1721 г. по решению Юстиц-коллегии, вследствие прошения Ивана Дмитриевича Плещеева, село Свиблово, находившееся во владении у Кирилла Алексеевича Нарышкина, было возвращено в род Плещеевых, и того же года оно утверждено за ним, Иваном Плещеевым, отказною книгою: «отказано стольнику Ивану Дмитриевичу Плещееву ближней его родственницы девицы Марьи Семеновны Плещеевой в Московском уезде село Свиблово, а в том селе Божия церковь во имя св. Троицы, да придел великомученика Георгия, каменная и колокольня каменная ж с колоколами, палаты и погреба, и поварня, и людские покои, и солодовенный завод каменный же, светлицы и конюшенный двор, людские покои и хлебные амбары деревянные; мельница на реке Яузе о четырех поставах, двор мельника, а в нем живут два иноземца, да в том же селе 4 пруда с рыбами».
По смерти И. Д. Плещеева это село перешло в 1728 г. к его сыну Семену с матерью вдовою Анною Дорофеевною Плещеевой, с этим имением вышедшей замуж за князя Петра Яковлевича Голицына. Троицкая церковь в селе Свиблове по приходным книгам Патриаршего казенного приказа писалась под Селецкою десятиною, за 1678-89 гг. «в вотчине стольника Михаила Плещеева», а в 1690-1740 гг. «в вотчине стольников Семена и Федора Федоровичей Плещеевых», с обозначением дани с 1712 г. 39 алтын 2 деньги.
Холмогоров В. И., Холмогоров Г. И. «Исторические материалы о церквах и селах XVI – XVIII ст.» Выпуск 4, Селецкая десятина Московского уезда. Издание Императорского Общества Истории и Древностей Российских при Московском Университете. Москва, в Университетской типографии (М. Катков), на Страстном бульваре, 1885 г.