Отделение душевнобольных при Военно-медицинской академии открылось в 1859 в одном из ее флигелей. Через четверть века встал вопрос о постройке отдельного здания. 16 декабря 1886 был утвержден представленный воен. инж. Г. С. Войницким проект образцовой клиники на 100 больных и следующей весной началось его осуществление под наблюдением комиссии, в которую входили известные психиатры: директор клиники проф. И. П. Мержеевский и ее бывший директор – „отец русской психиатрии“ проф. И. М. Балинский. Комплекс клиники состоял из главного трехэтажного здания и соединенных с ним двухэтажных флигелей и павильонов. В одном из павильонов находились зимний сад, гимнастический и концертный залы; в главном здании – аудитории, лаборатории и лекционный зал. Решеток на окнах не было, их заменяло особо прочное стекло. Строительство стоило 1 млн руб. Клиника была одной из лучших в Европе.
Церковь в ней оборудовали на верхнем этаже, над входом. Она была освящена вместе с клиникой 24 июня 1892 протопресвитером А. А. Желобовским в присутствии принца А. П. Ольденбургского. В 1896–1897 невдалеке, на Нюстадской улице (ныне – Лесной пр., 2), была возведена клиника нервных болезней, которую переходом соединили с вышеназванной, отчего в храме молились пациенты обеих больниц.
Священником перед Октябрьской революцией служил о. Александр Максимилианович Синицын. Церковь, приписанная к церкви Божией Матери Смоленской при Императорской Военно-медицинской академии, в марте 1919 стала приходской. 13 декабря 1922 ее закрыли, а помещение передали под аудиторию Академии. Ныне в здании находится кафедры и клиники психиатрии и военно-полевой хирургии.
"Святыни Петербурга" (В. В. Антонов, А.В. Кобак, 2003), стр. 226-227
Церковь с тем же названием возрождена в восточном крыле клиники психиатрии. С декабря 2007 г. возобновлены регулярные богослужения.